El Hospital está gestionado por la Orden Hospitalaria de San Juan de Dios, actuando como Órgano colegiado de gestión el Comité de Dirección constituido por:
- Directora Gerente: Dra. Patricia Segura Sádaba.
- Adjunta a Gerencia: Eider Etxeberria Oiarbide.
- Jefatura del Área Asistencial: Dra. Amaia Campo Núñez.
- Dirección de Enfermería: Mª Asunción Sánchez Ruiz.
- Dirección Económica y Administrativa: Begoña Azanza Crespo.
- Dirección de RR.HH, Calidad y Organización: David Iriarte Aguirre.
