En 2016 el Hospital San Juan de Dios de Pamplona inauguró su nueva estructura, culminando su proyecto de renovación.

El diseño del nuevo hospital se basó en dos líneas de actuación:

• Construcción de un edificio de nueva planta.
• Renovación del antiguo edificio que albergó el hospital original, una arquitectura protegida por la Institución Príncipe de Viana y diseñada en el siglo pasado por el arquitecto Víctor Eusa.

La obra, que supuso una inversión de 42 millones de euros, ha triplicado el tamaño del hospital  original (31.400 m²), lo ha dotado tecnológicamente y le ha concedido espacios y confort para el usuario.

Entre las principales novedades que se han incorporado cabe destacar:

• Reforma de la Unidad de Rehabilitación Ambulatoria de 300 m².
• Creación de Unidad de Rehabilitación para Paciente Ingresado de 600 m².
• Nuevo Bloque Quirúrgico, con 11 nuevos quirófanos: 8 Cirugía Mayor Ambulatoria/3 de Cirugía Menor.
• 144 habitaciones equipadas (la mayor parte de uso individual).
• Nuevo Servicio de Imagen/Radiología, con TAC
• Nuevo Laboratorio.
• Nuevas Consultas externas.
• Nueva Farmacia.

El Hospital completa sus instalaciones con dotaciones adicionales: parking subterráneo con capacidad, cafetería y la implantación de sistemas de ahorro y eficiencia energética.